Так, например, комплекс ядер, расположенных в продолговатом мозге, выполняет функции дыхательного центра, регулирующего как вдох, так и выдох. Одни ядра среднего мозга представляют собой первичные зрительные, другие - слуховые центры, третьи — центры мышечного тонуса...
Особо следует выделить ретикулярную, или сетевидную, формацию мозгового ствола. Она образована крупными и мелкими ядрами, которые соединены между собой густой сетью нервных волокон. Эта структура выполняет функции связного между различными частями центральной нервной системы. Ей также отводится роль энергетического центра мозга, непрерывно как бы подзаряжающего энергией и активизирующего кору больших полушарий.
Промежуточный мозг расположен на границе с полушариями большого мозга. В него входят правый и левый таламусы, или зрительные бугры, являющиеся как бы последней инстанцией, через которую проходят все чувствительные нервные пути, направляющиеся в кору больших полушарий.
В промежуточном мозге находится и гипоталамус, или подбугорье.
На весьма небольшом участке мозга, который занимает гипоталамус, сосредоточено более сорока различных ядер; обычно их делят на передние, средние и задние. Это центры вегетативной нервной системы, регулирующие обмен веществ в организме (воды, солей, белков, углеводов и т.д.), температуру тела, работу органов сердечно-сосудистой, пищеварительной, выделительной и других систем.
Гипоталамус имеет связь практически со всеми отделами мозга, но особенно тесно и анатомически и функционально он связан с лежащим рядом гипофизом.